数组接口协议#

注意

此页面描述了 NumPy 特定的 API,用于从其他 C 扩展访问 NumPy 数组的内容。PEP 3118The Revised Buffer Protocol 为任何扩展模块引入了类似的、标准化的 API 用于 Python 2.6 和 3.0。Cython 的缓冲区数组支持使用PEP 3118 API;参见Cython NumPy 教程。Cython 提供了一种编写代码的方法,该代码支持 Python 2.6 之前的版本的缓冲区协议,因为它具有一个利用此处描述的数组接口的向后兼容的实现。

版本:

3

数组接口(有时称为数组协议)于 2005 年创建,作为一种方法,使类似数组的 Python 对象尽可能智能地重用彼此的数据缓冲区。同构 N 维数组接口是对象共享 N 维数组内存和信息的一种默认机制。该接口由使用两个属性的 Python 端和 C 端组成。希望在应用程序代码中被视为 N 维数组的对象应该至少支持这些属性中的一个。希望在应用程序代码中支持 N 维数组的对象应该至少查找这些属性中的一个,并适当地使用提供的信息。

这个接口描述了同构数组,因为数组的每个项目都具有相同的“类型”。这种类型可以非常简单,也可以是一个相当任意和复杂的类 C 结构。

有两种使用该接口的方法:Python 端和 C 端。两者都是单独的属性。

Python 端#

这种接口方法包括对象具有 __array_interface__ 属性。

object.__array_interface__#

一个项目字典(3 个必需和 5 个可选)。如果未提供字典中的可选键,则具有隐含的默认值。

键为

shape (必需)

其元素是每个维度中数组大小的元组。每个条目都是一个整数(Python int)。请注意,这些整数可能大于平台 intlong 可以容纳的整数(Python int 是 C long)。使用此属性的代码应该适当地处理此问题;在可能发生溢出时引发错误,或者使用 long long 作为形状的 C 类型。

typestr (必需)

一个字符串,提供同构数组的基本类型。基本字符串格式由 3 部分组成:一个字符描述数据的字节序(<:小端,>:大端,|:不相关),一个字符代码给出数组的基本类型,以及一个整数,提供类型使用的字节数。

基本类型字符代码为

t

位字段(后面的整数给出位字段中的位数)。

b

布尔值(整数类型,所有值仅为 TrueFalse

i

整数

u

无符号整数

f

浮点数

c

复数浮点数

m

时间增量

M

日期时间

O

对象(即内存包含指向 PyObject 的指针)

S

字符串(固定长度的 char 序列)

U

Unicode(固定长度的 Py_UCS4 序列)

V

其他(void * – 每个项目都是固定大小的内存块)

descr (可选)

一个元组列表,提供对同构数组中每个项目的内存布局的更详细描述。列表中的每个元组都有两个或三个元素。通常,当 typestrV[0-9]+ 时,将使用此属性,但这并非必需。唯一的要求是 typestr 键中表示的字节数与此处表示的总字节数相同。其目的是支持构成数组元素的类 C 结构的描述。列表中每个元组的元素为

  1. 一个字符串,提供与数据类型这部分关联的名称。这也可以是一个 ('full name', 'basic_name') 元组,其中基本名称将是一个有效的 Python 变量名,代表字段的全名。

  2. typestr 中的另一个基本类型描述字符串或另一个列表(用于嵌套结构化类型)

  3. 一个可选的形状元组,提供结构的这部分应该重复多少次。如果没有给出,则假定没有重复。可以使用此通用接口描述非常复杂的结构。但是请注意,数组的每个元素仍然是相同的数据类型。下面给出了一些使用此接口的示例。

默认值[('', typestr)]

data (可选)

一个 2 元组,其第一个参数是指向存储数组内容的数据区域的 Python 整数

注意

当通过 PyLong_From* 或高级绑定(例如 Cython 或 pybind11)从 C/C++ 转换时,请确保使用足够大的位数的整数。

此指针必须指向数据的第一个元素(换句话说,在这种情况下始终忽略任何偏移量)。元组中的第二个条目是只读标志(true 表示数据区域为只读)。

此属性也可以是一个公开 缓冲区接口 的对象,这将用于共享数据。如果此键不存在(或返回 None),则将通过对象本身的缓冲区接口进行内存共享。在这种情况下,可以使用 offset 键来指示缓冲区的起始位置。如果要保护内存区域,则新对象必须存储公开数组接口的对象的引用。

默认值None

strides (可选)

或者是 None,指示 C 样式的连续数组,或者是一个步幅元组,它提供跳转到相应维度中的下一个数组元素所需的字节数。每个条目必须是一个整数(Python int)。与 shape 一样,这些值可能大于 C intlong 可以表示的值;调用代码应该适当地处理此问题,或者通过引发错误,或者在 C 中使用 long long。默认值为 None,这意味着 C 样式的连续内存缓冲区。在此模型中,数组的最后一个维度变化最快。例如,对于数组条目长度为 8 字节且形状为 (10, 20, 30) 的对象的默认步幅元组将为 (4800, 240, 8)

默认值None(C 样式连续)

mask (可选)

None 或一个公开数组接口的对象。掩码数组的所有元素都应该仅解释为真或非真,指示此数组的哪些元素有效。此对象的形状应该与原始数组的形状“广播”兼容。

默认值None(所有数组值均有效)

offset (可选)

数组数据区域中的整数偏移量。只有当 data 为 None 或返回 memoryview 对象时,才能使用此选项。

默认值0

version (必需)

一个整数,表示接口的版本(例如,此版本为 3)。注意不要使用此版本来使公开未来版本接口的对象失效。

C 结构体访问#

这种数组接口方法允许使用仅一个属性查找和一个定义良好的 C 结构体来更快地访问数组。

object.__array_struct__#

一个PyCapsule,其pointer成员包含指向已填充的PyArrayInterface结构体的指针。结构体的内存是动态创建的,并且PyCapsule也创建了适当的析构函数,因此此属性的检索器只需对通过此属性返回的对象应用Py_DECREF即可完成。此外,需要复制数据,或者必须持有公开此属性的对象的引用以确保数据不会被释放。如果其他对象正在引用它们,则公开__array_struct__接口的对象也不应重新分配其内存。

PyArrayInterface结构体在numpy/ndarrayobject.h中定义为

typedef struct {
  int two;              /* contains the integer 2 -- simple sanity check */
  int nd;               /* number of dimensions */
  char typekind;        /* kind in array --- character code of typestr */
  int itemsize;         /* size of each element */
  int flags;            /* flags indicating how the data should be interpreted */
                        /*   must set ARR_HAS_DESCR bit to validate descr */
  Py_ssize_t *shape;    /* A length-nd array of shape information */
  Py_ssize_t *strides;  /* A length-nd array of stride information */
  void *data;           /* A pointer to the first element of the array */
  PyObject *descr;      /* NULL or data-description (same as descr key
                                of __array_interface__) -- must set ARR_HAS_DESCR
                                flag or this will be ignored. */
} PyArrayInterface;

flags 成员可能由 5 位组成,表示如何解释数据,以及 1 位表示如何解释接口。数据位是NPY_ARRAY_C_CONTIGUOUS (0x1), NPY_ARRAY_F_CONTIGUOUS (0x2), NPY_ARRAY_ALIGNED (0x100), NPY_ARRAY_NOTSWAPPED (0x200) 和 NPY_ARRAY_WRITEABLE (0x400)。最后一个标志NPY_ARR_HAS_DESCR (0x800) 指示此结构体是否具有 arrdescr 字段。除非存在此标志,否则不应访问该字段。

NPY_ARR_HAS_DESCR#

2006 年 6 月 16 日起新增

过去,大多数实现使用PyCObject(现在是PyCapsule)的desc成员本身(不要将其与上面的PyArrayInterface结构体的“descr”成员混淆——它们是两个不同的东西)来保存指向公开接口的对象的指针。这现在是接口的显式部分。请务必引用该对象并调用PyCapsule_SetContext,然后再返回PyCapsule,并配置一个析构函数来递减此引用。

注意

__array_struct__被认为是遗留的,不应在新的代码中使用。请改用缓冲协议或 DLPack 协议numpy.from_dlpack

类型描述示例#

为了清晰起见,提供一些类型描述和相应的__array_interface__“descr”条目的示例很有用。感谢 Scott Gilbert 提供这些示例。

在每种情况下,“descr”键都是可选的,但当然它提供了更多信息,这对于各种应用程序可能很重要。

* Float data
    typestr == '>f4'
    descr == [('','>f4')]

* Complex double
    typestr == '>c8'
    descr == [('real','>f4'), ('imag','>f4')]

* RGB Pixel data
    typestr == '|V3'
    descr == [('r','|u1'), ('g','|u1'), ('b','|u1')]

* Mixed endian (weird but could happen).
    typestr == '|V8' (or '>u8')
    descr == [('big','>i4'), ('little','<i4')]

* Nested structure
    struct {
        int ival;
        struct {
            unsigned short sval;
            unsigned char bval;
            unsigned char cval;
        } sub;
    }
    typestr == '|V8' (or '<u8' if you want)
    descr == [('ival','<i4'), ('sub', [('sval','<u2'), ('bval','|u1'), ('cval','|u1') ]) ]

* Nested array
    struct {
        int ival;
        double data[16*4];
    }
    typestr == '|V516'
    descr == [('ival','>i4'), ('data','>f8',(16,4))]

* Padded structure
    struct {
        int ival;
        double dval;
    }
    typestr == '|V16'
    descr == [('ival','>i4'),('','|V4'),('dval','>f8')]

应该清楚的是,可以使用此接口描述任何结构化类型。

与数组接口(版本 2)的差异#

版本 2 接口非常相似。差异主要在于美观方面。特别是

  1. PyArrayInterface 结构体末尾没有 descr 成员(因此也没有 ARR_HAS_DESCR 标志)。

  2. 来自__array_struct__PyCapsulecontext成员(正式的PyCObjectdesc成员)未指定。通常,它是公开数组的对象(以便在 C 对象被销毁时可以保留并销毁对它的引用)。现在明确要求以某种方式使用此字段来保存对拥有对象的引用。

    注意

    截止 2020 年 8 月,文档是这样说的:

    现在它必须是一个元组,其第一个元素是一个包含“PyArrayInterface 版本 #”的字符串,第二个元素是公开数组的对象。

    这个设计在提出后几乎立即被撤回,详情参见<https://mail.python.org/pipermail/numpy-discussion/2006-June/020995.html>。尽管 14 年来的文档与之相反,但在任何时候都不可以假设__array_interface__胶囊包含此元组内容。

  3. __array_interface__['data']返回的元组曾经是一个十六进制字符串(现在是一个整数或长整数)。

  4. 没有__array_interface__属性,而是__array_interface__字典中的所有键(版本除外)都是它们自己的属性:因此,要获取 Python 端的信息,您必须分别访问属性

    • __array_data__

    • __array_shape__

    • __array_strides__

    • __array_typestr__

    • __array_descr__

    • __array_offset__

    • __array_mask__