NumPy 2.0 迁移指南#
本文档包含一套关于如何更新代码以与 NumPy 2.0 协同工作的说明。它涵盖了 NumPy 的 Python 和 C API 中的更改。
注意
请注意,NumPy 2.0 也打破了二进制兼容性——如果您正在分发依赖 NumPy C API 的 Python 包的二进制文件,请参阅 NumPy 2.0 特定建议。
Ruff 插件#
2.0 发布说明和本迁移指南中涵盖的许多更改,都可以通过专门的 Ruff 规则,即规则 NPY201,在下游代码中自动进行调整。
您应该安装 ruff>=0.4.8
并将 NPY201
规则添加到您的 pyproject.toml
中
[tool.ruff.lint]
select = ["NPY201"]
您也可以直接从命令行应用 NumPy 2.0 规则
$ ruff check path/to/code/ --select NPY201
NumPy 数据类型提升的更改#
NumPy 2.0 按照 NEP 50 的规定更改了提升(组合不同数据类型的结果)。有关此更改的详细信息,请参阅 NEP。它包含一个示例更改表和一个向后兼容性部分。
最大的向后兼容性更改是现在一致地保留了标量的精度。两个示例如下:
np.float32(3) + 3.
现在返回一个 float32,而以前返回一个 float64。np.array([3], dtype=np.float32) + np.float64(3)
现在将返回一个 float64 数组。(标量更高的精度不会被忽略。)
对于浮点值,这可能导致与标量一起工作时结果精度降低。对于整数,可能出现错误或溢出。
为了解决这个问题,您可以显式地进行类型转换。很多时候,通过 int()
、float()
或 numpy_scalar.item()
确保您使用 Python 标量,也可能是一个很好的解决方案。
要追踪更改,您可以启用对已更改行为发出警告(使用 warnings.simplefilter
将其作为错误抛出以获取回溯)。
np._set_promotion_state("weak_and_warn")
这在测试期间很有用。不幸的是,运行此操作可能会标记许多在实践中不相关的更改。
Windows 默认整数#
NumPy 使用的默认整数现在在所有 64 位系统上都是 64 位(在 32 位系统上是 32 位)。由于与 Python 2 相关的历史原因,它以前等同于 C long
类型。默认整数现在等同于 np.intp
。
大多数最终用户不应受到此更改的影响。一些操作将使用更多内存,但一些操作实际上可能会变得更快。如果您由于调用用编译语言编写的库而遇到问题,显式转换为 long
可能会有所帮助,例如使用:arr = arr.astype("long", copy=False)
。
如果用 C、Cython 或类似语言编写的与编译代码交互的库正在 C 侧使用 long
或等效类型,则可能需要更新以适应用户输入。在这种情况下,您可能希望使用 intp
并转换用户输入或同时支持 long
和 intp
(以更好地支持 NumPy 1.x)。在 C 或 Cython 中创建新的整数数组时,新的 NPY_DEFAULT_INT
宏将根据 NumPy 版本评估为 NPY_LONG
或 NPY_INTP
。
请注意,NumPy 随机 API 不受此更改的影响。
C-API 更改#
由于过时或难以维护,某些定义被移除或替换。一些新的 API 定义在 NumPy 2.0 和 NumPy 1.x 之间运行时评估方式不同。有些定义在 numpy/_core/include/numpy/npy_2_compat.h
中(例如 NPY_DEFAULT_INT
),可以全部或部分复制,以便在针对 NumPy 1.x 编译时可以使用这些定义。
如有必要,可以使用 PyArray_RUNTIME_VERSION >= NPY_2_0_API_VERSION
来明确实现 NumPy 1.x 和 2.0 上的不同行为。(兼容头文件以兼容此类使用的方式定义了它。)
如果您需要其他解决方法,请告诉我们。
PyArray_Descr
结构已更改#
最有影响力的 C-API 更改之一是 PyArray_Descr
结构现在变得更加不透明,以允许我们添加额外的标志,使元素大小不受 int
大小的限制,并允许将来改进结构化 dtype,而不会给新的 dtype 带来字段负担。
仅使用类型编号和其他初始字段的代码不受影响。大多数代码希望主要访问 ->elsize
字段,当 dtype/descriptor 本身附属于数组时(例如 arr->descr->elsize
),最好将其替换为 PyArray_ITEMSIZE(arr)
。
在不可能的情况下,需要新的访问函数
PyDataType_ELSIZE
和PyDataType_SET_ELSIZE
(请注意,结果现在是npy_intp
而不是int
)。PyDataType_ALIGNMENT
PyDataType_FIELDS
、PyDataType_NAMES
、PyDataType_SUBARRAY
PyDataType_C_METADATA
Cython 代码应使用 Cython 3,在这种情况下,更改是透明的。(在仅为 NumPy 2 编译时,elsize 和 alignment 可通过结构体访问。)
为了同时使用 1.x 和 2.x 进行编译,如果您使用这些新的访问器,很不幸需要通过宏在本地定义它们,例如
#if NPY_ABI_VERSION < 0x02000000
#define PyDataType_ELSIZE(descr) ((descr)->elsize)
#endif
或者将 npy2_compat.h
添加到您的代码库中,并在使用 NumPy 1.x 编译时明确包含它(因为它们是新的 API)。包含该文件对 NumPy 2 没有影响。
如果您需要帮助或提供的函数不足,请随时在 NumPy 中提出问题。
自定义用户 DType:现有用户 DType 现在必须使用 PyArray_DescrProto
来定义其 dtype 并稍微修改代码。请参阅 PyArray_RegisterDataType
中的注意事项。
功能已移至需要 import_array()
的头文件中#
如果您以前只包含了 ndarraytypes.h
,您可能会发现某些功能不再可用,并且需要包含 ndarrayobject.h
或类似文件。当您将 npy_2_compat.h
导入到您自己的代码库中时,也需要此包含,以便在使用 NumPy 1.x 编译时可以使用新的定义。
以前不需要导入的功能包括
访问 dtype 标志的函数:
PyDataType_FLAGCHK
、PyDataType_REFCHK
和相关的NPY_BEGIN_THREADS_DESCR
。PyArray_GETITEM
和PyArray_SETITEM
。
警告
重要的是,当使用 npy_2_compat.h
头文件时,必须使用 import_array()
机制来确保 NumPy API 完全可访问。在大多数情况下,您的扩展模块可能已经调用了它。但是,如果还没有,我们已经添加了 PyArray_ImportNumPyAPI()
作为确保 NumPy API 被导入的更好方式。此函数在多次调用时是轻量级的,因此您可以将其插入到任何需要的地方(如果您希望避免在模块导入时设置它)。
最大维度数增加#
最大维度数(和参数)已增加到 64。这会影响 NPY_MAXDIMS
和 NPY_MAXARGS
宏。最好审查它们的使用,我们通常鼓励您不要使用这些宏(尤其是 NPY_MAXARGS
),以便 NumPy 的未来版本可以取消此维度限制。
NPY_MAXDIMS
在 C-API 中也用于表示 axis=None
,包括 PyArray_AxisConverter
。后者将返回 -2147483648
作为轴(最小整数值)。其他函数可能报错 AxisError: axis 64 is out of bounds for array of dimension
,在这种情况下,您需要传入 NPY_RAVEL_AXIS
而不是 NPY_MAXDIMS
。NPY_RAVEL_AXIS
在 npy_2_compat.h
头文件中定义,并依赖于运行时(在 NumPy 1.x 上映射到 32,在 NumPy 2.x 上映射到 -2147483648
)。
复数类型 - 底层类型更改#
所有复数类型的底层 C 类型已更改为使用原生的 C99 类型。虽然这些类型的内存布局与 NumPy 1.x 中使用的类型保持相同,但 API 略有不同,因为不再可能直接访问字段(如 c.real
或 c.imag
)。
建议使用函数 npy_creal
和 npy_cimag
(以及相应的 float 和 long double 变体)来检索复数的实部或虚部,因为这些函数在 NumPy 1.x 和 NumPy 2.x 中都有效。已添加新函数 npy_csetreal
和 npy_csetimag
,以及兼容宏 NPY_CSETREAL
和 NPY_CSETIMAG
(以及相应的 float 和 long double 变体),用于设置实部或虚部。
在 C++ 中,底层类型仍然是结构体(以上所有内容仍然有效)。
这会影响 Cython。建议始终使用原生 typedefs cfloat_t
、cdouble_t
、clongdouble_t
,而不是 NumPy 类型 npy_cfloat
等,除非您必须与使用 NumPy 类型编写的 C 代码进行接口。您仍然可以使用 c.real
和 c.imag
属性(使用原生 typedefs)编写 Cython 代码,但不能再在 Cython 的 c++ 模式中使用就地运算符 c.imag += 1
。
因为 NumPy 2 现在包含了 complex.h
,所以使用名为 I
的变量的代码可能会看到以下错误:
现在,要使用名称 I
需要一个 #undef I
。
注意
NumPy 2.0.1 曾短暂包含 #undef I
,以帮助尚未包含 complex.h
的用户。
命名空间更改#
在 NumPy 2.0 中,某些函数、模块和常量被移动或移除,以通过删除不必要或过时的功能并澄清 NumPy 的哪些部分被认为是私有的来使 NumPy 命名空间更易于使用。请参阅下表以获取迁移指导。对于大多数更改,这意味着将其替换为向后兼容的替代方案。
有关更多详细信息,请参阅 NEP 52 — NumPy 2.0 的 Python API 清理。
主命名空间#
主 np
命名空间中约有 100 个成员已被弃用、移除或移至新位置。这样做是为了减少混乱并建立访问给定属性的唯一方式。下表显示了已移除的成员
已移除成员 |
迁移指南 |
---|---|
add_docstring |
它仍然作为 |
add_newdoc |
它仍然作为 |
add_newdoc_ufunc |
这是一个内部函数,没有替代品。 |
alltrue |
改用 |
asfarray |
改用带浮点 dtype 的 |
byte_bounds |
现在可在 |
cast |
改用 |
cfloat |
改用 |
charrarray |
它仍然作为 |
clongfloat |
改用 |
compare_chararrays |
它仍然作为 |
compat |
没有替代品,因为 Python 2 不再受支持。 |
complex_ |
改用 |
cumproduct |
改用 |
DataSource |
它仍然作为 |
deprecate |
直接使用 |
deprecate_with_doc |
直接使用 |
disp |
改用您自己的打印函数。 |
fastCopyAndTranspose |
改用 |
find_common_type |
改用 |
format_parser |
它仍然作为 |
get_array_wrap |
|
float_ |
改用 |
geterrobj |
改用 np.errstate 上下文管理器。 |
Inf |
改用 |
Infinity |
改用 |
infty |
改用 |
issctype |
改用 |
issubclass_ |
改用内置的 |
issubsctype |
改用 |
mat |
改用 |
maximum_sctype |
改用特定的 dtype。您应避免依赖任何隐式机制,并在代码中明确选择一种类型中最大的 dtype。 |
NaN |
改用 |
nbytes |
改用 |
NINF |
改用 |
NZERO |
改用 |
longcomplex |
改用 |
longfloat |
改用 |
lookfor |
直接搜索 NumPy 的文档。 |
obj2sctype |
改用 |
PINF |
改用 |
product |
改用 |
PZERO |
改用 |
recfromcsv |
改用 |
recfromtxt |
改用 |
round_ |
改用 |
safe_eval |
改用 |
sctype2char |
改用 |
sctypes |
改为显式访问 dtypes。 |
seterrobj |
改用 np.errstate 上下文管理器。 |
set_numeric_ops |
对于一般情况,请使用 |
set_string_function |
改用 |
singlecomplex |
改用 |
string_ |
改用 |
sometrue |
改用 |
source |
改用 |
tracemalloc_domain |
现在可从 |
unicode_ |
改用 |
who |
改用 IDE 变量浏览器或 |
如果表中不包含您正在使用但在 2.0
中已移除的项,则表示它是私有成员。您应该使用现有 API,或者在不可行的情况下,向我们提出恢复已移除条目的请求。
下表列出了已弃用的成员,这些成员将在 2.0
之后的版本中移除
已弃用成员 |
迁移指南 |
---|---|
in1d |
改用 |
row_stack |
改用 |
trapz |
改用 |
最后,已移除一组内部枚举。由于它们未在下游库中使用,我们不提供如何替换它们的信息。
[FLOATING_POINT_SUPPORT
, FPE_DIVIDEBYZERO
, FPE_INVALID
, FPE_OVERFLOW
, FPE_UNDERFLOW
, UFUNC_BUFSIZE_DEFAULT
, UFUNC_PYVALS_NAME
, CLIP
, WRAP
, RAISE
, BUFSIZE
, ALLOW_THREADS
, MAXDIMS
, MAY_SHARE_EXACT
, MAY_SHARE_BOUNDS
]
numpy.lib 命名空间#
np.lib
中的大多数函数也存在于主命名空间中,那是它们的主要位置。为了明确如何访问每个公共函数,np.lib
现在为空,仅包含少数专门的子模块、类和函数
array_utils
、format
、introspect
、mixins
、npyio
、scimath
和stride_tricks
子模块,Arrayterator
和NumpyVersion
类,add_docstring
和add_newdoc
函数,tracemalloc_domain
常量。
如果您在访问 np.lib
中的属性时遇到 AttributeError
,则应尝试从主 np
命名空间访问它。如果主命名空间中也缺少该项,则表示您正在使用私有成员。您应该使用现有 API,或者在不可行的情况下,向我们提出恢复已移除条目的请求。
numpy.core 命名空间#
np.core
命名空间现在正式设为私有,并已更名为 np._core
。用户不应直接从 _core
中获取成员——而应使用主命名空间来访问相关属性。_core
模块的布局未来可能会在不通知的情况下更改,这与遵循弃用期策略的公共模块不同。如果主命名空间中也缺少某个项,则您应该使用现有 API,或者在不可行的情况下,向我们提出恢复已移除条目的请求。
ndarray 和标量方法#
np.ndarray
和 np.generic
标量类中的一些方法已被移除。下表提供了已移除成员的替代方案
已失效成员 |
迁移指南 |
---|---|
newbyteorder |
改用 |
ptp |
改用 |
setitem |
改用 |
numpy.strings 命名空间#
已创建新的 numpy.strings
命名空间,其中大多数字符串操作都以 ufuncs 的形式实现。旧的 numpy.char
命名空间仍然可用,并且在可能的情况下,使用新的 ufuncs 以提高性能。我们建议今后使用 strings
函数。char
命名空间将来可能会被弃用。
其他更改#
关于 pickled 文件的注意事项#
NumPy 2.0 旨在加载使用 NumPy 1.26 创建的 pickle 文件,反之亦然。对于 1.25 及更早版本,加载 NumPy 2.0 pickle 文件将抛出异常。
适应 copy
关键字的更改#
copy 关键字行为的变化 在 asarray
、array
和 ndarray.__array__
中,可能需要进行这些更改:
使用
np.array(..., copy=False)
的代码在大多数情况下可以改为np.asarray(...)
。旧代码倾向于这样使用np.array
是因为它比默认的np.asarray
按需复制行为开销更小。现在情况已非如此,np.asarray
是首选函数。对于需要显式传递
None
/False
意为“如果需要则复制”以兼容 NumPy 1.x 和 2.x 的代码,请参阅 scipy#20172 以获取如何操作的示例。对于非 NumPy 类似数组对象的任何
__array__
方法,必须在签名中添加dtype=None
和copy=None
关键字——这同样适用于较旧的 NumPy 版本(尽管较旧的 NumPy 版本永远不会传入copy
关键字)。如果将关键字添加到__array__
签名中,则对于copy=True
和任何dtype
值始终返回一个新副本,copy=None
如果需要则创建副本(例如通过dtype
),copy=False
绝不能创建副本。如果需要创建副本以返回 NumPy 数组或满足dtype
,则引发异常(ValueError
)。
编写依赖 NumPy 版本的代码#
明确根据 numpy
版本进行分支的代码应该很少见——在大多数情况下,代码可以重写为同时兼容 1.x 和 2.0。但是,如果确实有必要,这里有一个建议的代码模式可以使用,利用 numpy.lib.NumpyVersion
# example with AxisError, which is no longer available in
# the main namespace in 2.0, and not available in the
# `exceptions` namespace in <1.25.0 (example uses <2.0.0b1
# for illustrative purposes):
if np.lib.NumpyVersion(np.__version__) >= '2.0.0b1':
from numpy.exceptions import AxisError
else:
from numpy import AxisError
此模式将正确运行,包括与 NumPy 发布候选版本一起,这在 2.0.0 发布期间非常重要。