高级 F2PY 用例#
向 F2PY 生成的模块添加用户定义的函数#
可以使用 usercode 和 pymethoddef 语句在签名文件中定义用户定义的 Python C/API 函数(它们必须在 python module 块内使用)。例如,以下签名文件 spam.pyf
! -*- f90 -*-
python module spam
usercode '''
static char doc_spam_system[] = "Execute a shell command.";
static PyObject *spam_system(PyObject *self, PyObject *args)
{
char *command;
int sts;
if (!PyArg_ParseTuple(args, "s", &command))
return NULL;
sts = system(command);
return Py_BuildValue("i", sts);
}
'''
pymethoddef '''
{"system", spam_system, METH_VARARGS, doc_spam_system},
'''
end python module spam
包装 C 库函数 system()
f2py -c spam.pyf
在 Python 中,这可以这样使用:
>>> import spam
>>> status = spam.system('whoami')
pearu
>>> status = spam.system('blah')
sh: line 1: blah: command not found
添加用户定义的变量#
以下示例说明如何通过修改 F2PY 生成模块的字典来向 F2PY 生成的扩展模块添加用户定义的变量。考虑以下签名文件(使用 f2py -c var.pyf 编译)
! -*- f90 -*-
python module var
usercode '''
int BAR = 5;
'''
interface
usercode '''
PyDict_SetItemString(d,"BAR",PyLong_FromLong(BAR));
'''
end interface
end python module
请注意,第二个 usercode 语句必须定义在 interface 块内,并且可以通过变量 d 访问模块字典(有关更多详细信息,请参阅 f2py var.pyf 生成的 varmodule.c)。
在 Python 中使用
>>> import var
>>> var.BAR
5
处理 KIND 说明符#
目前,F2PY 只能处理 <type spec>(kind=<kindselector>) 声明,其中 <kindselector> 是一个数字整数(例如 1、2、4、...),但不能是函数调用 KIND(..) 或任何其他表达式。F2PY 需要知道对应的 C 类型是什么,并且一个通用的解决方案会过于复杂而难以实现。
但是,F2PY 提供了一个解决方法来克服这个困难,即用户可以定义自己的 <Fortran 类型> 到 <C 类型> 的映射。例如,如果 Fortran 90 代码包含
REAL(kind=KIND(0.0D0)) ...
然后创建一个包含 Python 字典的映射文件
{'real': {'KIND(0.0D0)': 'double'}}
例如。
使用 --f2cmap 命令行选项将文件名传递给 F2PY。默认情况下,F2PY 假定文件名是当前工作目录中的 .f2py_f2cmap。
更一般地说,f2cmap 文件必须包含一个字典,其中包含以下项:
<Fortran typespec> : {<selector_expr>:<C type>}
定义 Fortran 类型之间的映射
<Fortran typespec>([kind=]<selector_expr>)
和相应的 <C 类型>。<C 类型> 可以是以下之一:
double
float
long_double
char
signed_char
unsigned_char
short
unsigned_short
int
long
long_long
unsigned
complex_float
complex_double
complex_long_double
string
例如,对于包含以下内容的 Fortran 文件 func1.f
subroutine func1(n, x, res)
use, intrinsic :: iso_fortran_env, only: int64, real64
implicit none
integer(int64), intent(in) :: n
real(real64), intent(in) :: x(n)
real(real64), intent(out) :: res
Cf2py intent(hide) :: n
res = sum(x)
end
为了将 int64 和 real64 转换为有效的 C 数据类型,可以在当前目录中创建一个具有以下内容的 .f2py_f2cmap 文件
dict(real=dict(real64='double'), integer=dict(int64='long long'))
并照常创建模块。F2PY 检查当前目录中是否存在 .f2py_f2cmap 文件,并将其用于将 KIND 说明符映射到 C 数据类型。
f2py -c func1.f -m func1
或者,可以将映射文件保存为任何其他名称,例如 mapfile.txt,然后可以使用 --f2cmap 选项将此信息传递给 F2PY。
f2py -c func1.f -m func1 --f2cmap mapfile.txt
有关更多信息,请参阅 F2Py 源代码 numpy/f2py/capi_maps.py。
字符字符串#
假定长度的字符字符串#
在 Fortran 中,假定长度的字符字符串参数声明为 character*(*) 或 character(len=*),即这些参数的长度在运行时由实际的字符串参数决定。对于 intent(in) 参数,这种长度信息的缺失不会对 f2py 构建功能性包装函数造成问题。然而,对于 intent(out) 参数,长度信息的缺失会对 f2py 生成的包装器造成问题,因为没有可用的大小信息来为这些参数创建内存缓冲区,并且 F2PY 假定长度为 0。根据假定长度字符字符串的长度指定方式,存在克服此问题的方法,如下例所示。
如果 character*(*) 输出参数的长度由其他输入参数的状态决定,则可以在签名文件中或在 f2py 注释中建立所需的连接,通过为相应参数添加额外的声明来指定长度,该声明在字符选择器部分指定长度。例如,考虑 Fortran 文件 asterisk1.f90
subroutine foo1(s)
character*(*), intent(out) :: s
!f2py character(f2py_len=12) s
s = "123456789A12"
end subroutine foo1
使用 f2py -c asterisk1.f90 -m asterisk1 编译它,然后在 Python 中
>>> import asterisk1
>>> asterisk1.foo1()
b'123456789A12'
请注意,额外的声明 character(f2py_len=12) s 仅被 f2py 解释,并且在 f2py_len= 规范中可以使用 C 表达式作为长度值。
在以下示例中
subroutine foo2(s, n)
character(len=*), intent(out) :: s
integer, intent(in) :: n
!f2py character(f2py_len=n), depend(n) :: s
s = "123456789A123456789B"(1:n)
end subroutine foo2
输出的假定长度字符串的长度取决于输入参数 n,在通过 F2PY 包装后,在 Python 中
>>> import asterisk
>>> asterisk.foo2(2)
b'12'
>>> asterisk.foo2(12)
b'123456789A12'
>>>