代码模板化和简化样板代码#
使用 FYPP 绑定通用接口#
f2py 目前不支持接口块绑定。但是,有一些变通方法。也许最著名的是使用 tempita 来使用 .pyf.src 文件,正如 scipy 中的绑定中所做的那样。无论如何,tempita 的支持已被移除,不再推荐使用。
注意
f2py 本身不支持接口的原因是它们不对应于已编译库中的导出符号。
❯ nm gen.o
0000000000000078 T __add_mod_MOD_add_complex
0000000000000000 T __add_mod_MOD_add_complex_dp
0000000000000150 T __add_mod_MOD_add_integer
0000000000000124 T __add_mod_MOD_add_real
00000000000000ee T __add_mod_MOD_add_real_dp
在这里,我们将讨论一些技术,以利用 f2py 与 fypp 结合使用来模拟通用接口并简化多个(相似)函数的绑定。
基本示例:加法模块#
让我们以用户指南(F2PY 示例)中的示例为基础,该示例包含一个子例程,该子例程接收两个数组并返回它们的和。
C
SUBROUTINE ZADD(A,B,C,N)
C
DOUBLE COMPLEX A(*)
DOUBLE COMPLEX B(*)
DOUBLE COMPLEX C(*)
INTEGER N
DO 20 J = 1, N
C(J) = A(J)+B(J)
20 CONTINUE
END
我们将将其重写为现代 Fortran
module adder
implicit none
contains
subroutine zadd(a, b, c, n)
integer, intent(in) :: n
double complex, intent(in) :: a(n), b(n)
double complex, intent(out) :: c(n)
integer :: j
do j = 1, n
c(j) = a(j) + b(j)
end do
end subroutine zadd
end module adder
我们可以像在原始示例中一样继续,手动添加 intent 等,然而在实际生产中通常有其他考虑因素。首先,我们可以通过 FYPP 来模板化构造相似的函数
module adder
implicit none
contains
#:def add_subroutine(dtype_prefix, dtype)
subroutine ${dtype_prefix}$add(a, b, c, n)
integer, intent(in) :: n
${dtype}$, intent(in) :: a(n), b(n)
${dtype}$ :: c(n)
integer :: j
do j = 1, n
c(j) = a(j) + b(j)
end do
end subroutine ${dtype_prefix}$add
#:enddef
#:for dtype_prefix, dtype in [('i', 'integer'), ('s', 'real'), ('d', 'real(kind=8)'), ('c', 'complex'), ('z', 'double complex')]
@:add_subroutine(${dtype_prefix}$, ${dtype}$)
#:endfor
end module adder
这可以预处理以生成完整的 Fortran 代码
❯ fypp gen_adder.f90.fypp > adder.f90
正如预期的那样,之后可以使用 f2py 来包装它。
现在我们将考虑将绑定维护在一个单独的文件中。请注意以下可以通过 f2py -m adder adder_base.f90 -h adder.pyf 为单个子例程生成的 `.`pyf` 文件:
! -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.
python module adder ! in
interface ! in :adder
module adder ! in :adder:adder_base.f90
subroutine zadd(a,b,c,n) ! in :adder:adder_base.f90:adder
double complex dimension(n),intent(in) :: a
double complex dimension(n),intent(in),depend(n) :: b
double complex dimension(n),intent(out),depend(n) :: c
integer, optional,intent(in),check(shape(a, 0) == n),depend(a) :: n=shape(a, 0)
end subroutine zadd
end module adder
end interface
end python module adder
! This file was auto-generated with f2py (version:2.0.0.dev0+git20240101.bab7280).
! See:
! https://web.archive.org/web/20140822061353/http://cens.ioc.ee/projects/f2py2e
带文档字符串
c = zadd(a,b,[n])
Wrapper for ``zadd``.
Parameters
----------
a : input rank-1 array('D') with bounds (n)
b : input rank-1 array('D') with bounds (n)
Other Parameters
----------------
n : input int, optional
Default: shape(a, 0)
Returns
-------
c : rank-1 array('D') with bounds (n)
这已经很好了。然而,`n` 根本不应该被传递,所以我们将做一些小的调整。
! -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.
python module adder ! in
interface ! in :adder
module adder ! in :adder:adder_base.f90
subroutine zadd(a,b,c,n) ! in :adder:adder_base.f90:adder
integer intent(hide),depend(a) :: n=len(a)
double complex dimension(n),intent(in) :: a
double complex dimension(n),intent(in),depend(n) :: b
double complex dimension(n),intent(out),depend(n) :: c
end subroutine zadd
end module adder
end interface
end python module adder
! This file was auto-generated with f2py (version:2.0.0.dev0+git20240101.bab7280).
! See:
! https://numpy.com.cn/doc/stable/f2py/
这对应于
In [3]: ?adder.adder.zadd
Call signature: adder.adder.zadd(*args, **kwargs)
Type: fortran
String form: <fortran function zadd>
Docstring:
c = zadd(a,b)
Wrapper for ``zadd``.
Parameters
----------
a : input rank-1 array('D') with bounds (n)
b : input rank-1 array('D') with bounds (n)
Returns
-------
c : rank-1 array('D') with bounds (n)
最后,我们可以以类似的方式对此进行模板化,以达到原始目标,即拥有利用 f2py 指令且极少重复的绑定。
! -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.
python module adder ! in
interface ! in :adder
module adder ! in :adder:adder_base.f90
#:def add_subroutine(dtype_prefix, dtype)
subroutine ${dtype_prefix}$add(a,b,c,n) ! in :adder:adder_base.f90:adder
integer intent(hide),depend(a) :: n=len(a)
${dtype}$ dimension(n),intent(in) :: a
${dtype}$ dimension(n),intent(in),depend(n) :: b
${dtype}$ dimension(n),intent(out),depend(n) :: c
end subroutine ${dtype_prefix}$add
#:enddef
#:for dtype_prefix, dtype in [('i', 'integer'), ('s', 'real'), ('d', 'real(kind=8)'), ('c', 'complex'), ('z', 'complex(kind=8)')]
@:add_subroutine(${dtype_prefix}$, ${dtype}$)
#:endfor
end module adder
end interface
end python module adder
! This file was auto-generated with f2py (version:2.0.0.dev0+git20240101.bab7280).
! See:
! https://numpy.com.cn/doc/stable/f2py/
用法如下:
fypp gen_adder.f90.fypp > adder.f90
fypp adder.pyf.fypp > adder.pyf
f2py -m adder -c adder.pyf adder.f90 --backend meson