数组接口协议#
注意
本页面描述了 NumPy 特有的 API,用于从其他 C 扩展访问 NumPy 数组的内容。PEP 3118 – 修订后的缓冲区协议
引入了类似的标准化 API,供任何扩展模块使用。Cython 的缓冲区数组支持使用 PEP 3118 API;请参阅 Cython NumPy 教程。
- 版本:
3
数组接口(有时称为数组协议)创建于 2005 年,旨在使类似数组的 Python 对象在可能的情况下智能地重用彼此的数据缓冲区。同构 N 维数组接口是对象共享 N 维数组内存和信息的默认机制。该接口由一个 Python 侧和一个 C 侧组成,使用两个属性。在应用程序代码中希望被视为 N 维数组的对象应至少支持这些属性中的一个。在应用程序代码中希望支持 N 维数组的对象应查找这些属性中的至少一个,并适当使用所提供的信息。
此接口描述的是同构数组,即数组的每个项具有相同的“类型”。此类型可以非常简单,也可以是相当任意和复杂的 C 风格结构。
使用该接口有两种方式:Python 侧和 C 侧。两者是独立的属性。
Python 侧#
这种接口方法要求对象具有 __array_interface__
属性。
- object.__array_interface__#
一个包含项的字典(3 个必需,5 个可选)。如果未提供可选键,则它们具有隐含的默认值。
键包括
- shape (必需)
一个元组,其元素是数组在每个维度上的大小。每个条目都是一个整数(一个 Python
int
)。请注意,这些整数可能大于平台int
或long
所能容纳的大小(Pythonint
是 Clong
)。使用此属性的代码应适当处理这种情况;要么在可能溢出时引发错误,要么使用long long
作为形状的 C 类型。- typestr (必需)
一个字符串,提供同构数组的基本类型。基本字符串格式由 3 部分组成:一个描述数据字节序的字符(
<
:小端,>
:大端,|
:不相关),一个给出数组基本类型的字符代码,以及一个提供该类型所用字节数的整数。基本类型字符代码如下
- descr (可选)
一个元组列表,提供了同构数组中每个项的内存布局的更详细描述。列表中每个元组包含两个或三个元素。通常,当 typestr 为
V[0-9]+
时会使用此属性,但这并非必需。唯一的要求是 typestr 键中表示的字节数与此处表示的总字节数相同。其目的是支持构成数组元素的 C 风格结构体的描述。列表中每个元组的元素是一个字符串,提供了与此数据类型部分关联的名称。这也可以是
('完整名称', '基本名称')
的元组,其中基本名称将是表示字段完整名称的有效 Python 变量名。一个基本类型描述字符串,如 typestr 中所示,或另一个列表(用于嵌套结构化类型)
一个可选的形状元组,提供了此结构部分应重复的次数。如果未给出,则假定不重复。使用此通用接口可以描述非常复杂的结构。但请注意,数组的每个元素仍然是相同的数据类型。下面给出了一些使用此接口的示例。
默认值:
[('', typestr)]
- data (可选)
一个两元素元组,其第一个参数是一个指向存储数组内容的内存区域的 Python 整数。
注意
通过
PyLong_From*
或 Cython 或 pybind11 等高级绑定从 C/C++ 转换时,请确保使用足够大的位宽整数。此指针必须指向数据的第一个元素(换句话说,在这种情况下任何偏移量都将被忽略)。元组中的第二个条目是只读标志(true 表示数据区域是只读的)。
此属性也可以是公开 缓冲区接口 的对象,该对象将用于共享数据。如果此键不存在(或返回 None),则内存共享将通过对象自身的缓冲区接口完成。在这种情况下,offset 键可用于指示缓冲区的起始位置。如果内存区域要被保护,新对象必须存储对公开数组接口的对象的引用。
默认值:
None
- strides (可选)
要么是
None
表示 C 风格的连续数组,要么是步长元组,提供在相应维度中跳转到下一个数组元素所需的字节数。每个条目必须是整数(一个 Pythonint
)。与 shape 一样,值可能大于 Cint
或long
所能表示的大小;调用代码应适当处理此情况,要么引发错误,要么在 C 中使用long long
。默认值为None
,这意味着 C 风格的连续内存缓冲区。在此模型中,数组的最后一个维度变化最快。例如,对于数组条目为 8 字节长且形状为(10, 20, 30)
的对象,默认的步长元组将是(4800, 240, 8)
。默认值:
None
(C 风格连续)- mask (可选)
None
或一个公开数组接口的对象。掩码数组的所有元素应仅被解释为真或非真,以指示此数组的哪些元素是有效的。此对象的形状应可 “广播” 到原始数组的形状。默认值:
None
(所有数组值均有效)- offset (可选)
数组数据区域内的整数偏移量。这只能在 data 为
None
或返回memoryview
对象时使用。默认值:
0
。- version (必需)
一个整数,表示接口的版本(例如,此版本为 3)。请注意不要用此来使公开未来版本接口的对象失效。
C 结构体访问#
这种数组接口方法允许仅使用一个属性查找和一个定义良好的 C 结构体来更快地访问数组。
- object.__array_struct__#
一个
PyCapsule
,其pointer
成员包含指向已填充的PyArrayInterface
结构的指针。结构的内存是动态创建的,PyCapsule
也用适当的析构函数创建,因此此属性的检索者只需在完成后对该属性返回的对象应用Py_DECREF
。此外,要么需要复制出数据,要么必须保留对公开此属性的对象的引用,以确保数据不会被释放。公开__array_struct__
接口的对象,如果其他对象引用它们,也不得重新分配它们的内存。
PyArrayInterface
结构体定义在 numpy/ndarrayobject.h
中,如下所示:
typedef struct {
int two; /* contains the integer 2 -- simple sanity check */
int nd; /* number of dimensions */
char typekind; /* kind in array --- character code of typestr */
int itemsize; /* size of each element */
int flags; /* flags indicating how the data should be interpreted */
/* must set ARR_HAS_DESCR bit to validate descr */
Py_ssize_t *shape; /* A length-nd array of shape information */
Py_ssize_t *strides; /* A length-nd array of stride information */
void *data; /* A pointer to the first element of the array */
PyObject *descr; /* NULL or data-description (same as descr key
of __array_interface__) -- must set ARR_HAS_DESCR
flag or this will be ignored. */
} PyArrayInterface;
flags 成员可以包含 5 位,指示数据应如何解释,以及 1 位,指示接口应如何解释。数据位是 NPY_ARRAY_C_CONTIGUOUS
(0x1),NPY_ARRAY_F_CONTIGUOUS
(0x2),NPY_ARRAY_ALIGNED
(0x100),NPY_ARRAY_NOTSWAPPED
(0x200) 和 NPY_ARRAY_WRITEABLE
(0x400)。最后一个标志 NPY_ARR_HAS_DESCR
(0x800) 指示此结构是否包含 arrdescr 字段。除非存在此标志,否则不应访问该字段。
-
NPY_ARR_HAS_DESCR#
自 2006 年 6 月 16 日以来新增
过去,大多数实现都使用 PyCObject
(现在是 PyCapsule
)自身的 desc
成员(不要将其与上述 PyArrayInterface
结构体的“descr”成员混淆——它们是两个不同的东西)来保存公开接口的对象的指针。这现在是接口的明确部分。请务必在返回 PyCapsule
之前,获取对象的引用并调用 PyCapsule_SetContext
,并配置一个析构函数来减少此引用计数。
注意
__array_struct__
被认为是遗留产物,不应用于新代码。请改用 缓冲区协议 或 DLPack 协议 numpy.from_dlpack
。
类型描述示例#
为了清晰起见,提供一些类型描述和相应的 __array_interface__
'descr' 条目的示例会很有用。感谢 Scott Gilbert 提供的这些示例。
在每种情况下,'descr' 键都是可选的,但它当然提供了更多信息,这可能对各种应用程序很重要。
* Float data
typestr == '>f4'
descr == [('','>f4')]
* Complex double
typestr == '>c8'
descr == [('real','>f4'), ('imag','>f4')]
* RGB Pixel data
typestr == '|V3'
descr == [('r','|u1'), ('g','|u1'), ('b','|u1')]
* Mixed endian (weird but could happen).
typestr == '|V8' (or '>u8')
descr == [('big','>i4'), ('little','<i4')]
* Nested structure
struct {
int ival;
struct {
unsigned short sval;
unsigned char bval;
unsigned char cval;
} sub;
}
typestr == '|V8' (or '<u8' if you want)
descr == [('ival','<i4'), ('sub', [('sval','<u2'), ('bval','|u1'), ('cval','|u1') ]) ]
* Nested array
struct {
int ival;
double data[16*4];
}
typestr == '|V516'
descr == [('ival','>i4'), ('data','>f8',(16,4))]
* Padded structure
struct {
int ival;
double dval;
}
typestr == '|V16'
descr == [('ival','>i4'),('','|V4'),('dval','>f8')]
显然,任何结构化类型都可以使用此接口进行描述。
与数组接口(版本 2)的区别#
版本 2 接口非常相似。差异主要在于美学。特别是
PyArrayInterface 结构末尾没有 descr 成员(因此也没有标志 ARR_HAS_DESCR)
从
__array_struct__
返回的PyCapsule
(以前是PyCObject
的desc
成员)的context
成员未指定。通常,它是公开数组的对象(以便可以保留对它的引用,并在 C 对象销毁时销毁)。现在,明确要求以某种方式使用此字段来持有对拥有对象的引用。注意
直到 2020 年 8 月,这里写道
现在它必须是一个元组,其第一个元素是字符串“PyArrayInterface Version #”,第二个元素是公开数组的对象。
此设计在提出后几乎立即被撤回,见 https://mail.python.org/pipermail/numpy-discussion/2006-June/020995.html。尽管有 14 年的文档声称相反,但在任何时候都不能假定
__array_interface__
封装包含此元组内容。从
__array_interface__['data']
返回的元组以前是一个十六进制字符串(现在是一个整数或长整数)。以前没有
__array_interface__
属性,而是__array_interface__
字典中的所有键(版本除外)都是它们自己的属性:因此,要获取 Python 侧的信息,您必须单独访问这些属性:__array_data__
__array_shape__
__array_strides__
__array_typestr__
__array_descr__
__array_offset__
__array_mask__