numpy.memmap#

class numpy.memmap(filename, dtype=<class 'numpy.ubyte'>, mode='r+', offset=0, shape=None, order='C')[source]#

创建一个内存映射到磁盘上二进制文件中存储的数组。

内存映射文件用于访问磁盘上大型文件的小段,而无需将整个文件读入内存。NumPy 的 memmap 是类似数组的对象。这与 Python 的 mmap 模块不同,后者使用类似文件对象。

ndarray 的这个子类与某些操作存在一些不利的交互,因为它并不完全适合作为子类。使用这个子类的另一种方法是自行创建 mmap 对象,然后使用 ndarray.__new__ 直接创建一个 ndarray,在它的 ‘buffer=’ 参数中传递创建的对象。

这个类可能在某个时候变成一个工厂函数,它返回对 mmap 缓冲区的视图。

刷新 memmap 实例以将更改写入文件。目前没有 API 来关闭底层的 mmap。要确保资源实际关闭很困难,因为它可能在不同的 memmap 实例之间共享。

参数:
filenamestr、文件类对象或 pathlib.Path 实例

用作数组数据缓冲区的文件名或文件对象。

dtype数据类型,可选

用于解释文件内容的数据类型。默认值为 uint8.

mode{‘r+’, ‘r’, ‘w+’, ‘c’},可选

文件以这种模式打开

‘r’

以只读方式打开现有文件。

‘r+’

以读写方式打开现有文件。

‘w+’

创建或覆盖现有文件以进行读写。如果 mode == 'w+',则还必须指定 shape.

‘c’

写时复制:赋值会影响内存中的数据,但更改不会保存到磁盘。磁盘上的文件是只读的。

默认值为 ‘r+’。

offsetint,可选

在文件中,数组数据从这个偏移量开始。由于偏移量以字节为单位,因此它通常应该是 dtype 的字节大小的倍数。当 mode != 'r' 时,即使超过文件末尾的正偏移量也是有效的;文件将扩展以容纳额外的数据。默认情况下,即使 filename 是一个文件指针 fpfp.tell() != 0memmap 也会从文件开头开始。

shapeint 或 int 序列,可选

数组的期望形状。如果 mode == 'r' 并且在偏移量之后剩余的字节数不是 dtype 的字节大小的倍数,则必须指定 shape。默认情况下,返回的数组将是一维的,元素数量由文件大小和数据类型决定。

在版本 2.0 中更改: 形状参数现在可以是任何整数序列类型,以前类型仅限于元组和 int。

order{‘C’, ‘F’},可选

指定 ndarray 内存布局的顺序:行优先,C 风格或 列优先,Fortran 风格。这只有在形状大于一维时才有效。默认顺序为 ‘C’。

另请参见

lib.format.open_memmap

创建或加载内存映射的 .npy 文件。

备注

memmap 对象可以在任何接受 ndarray 的地方使用。给定一个 memmap fpisinstance(fp, numpy.ndarray) 返回 True

在 32 位系统上,内存映射文件的大小不能超过 2GB。

当 memmap 导致在文件系统中创建或扩展文件超过其当前大小时,新部分的内容是不确定的。在具有 POSIX 文件系统语义的系统上,扩展的部分将填充为零字节。

示例

>>> import numpy as np
>>> data = np.arange(12, dtype='float32')
>>> data.resize((3,4))

此示例使用临时文件,以便 doctest 不会将文件写入您的目录。您将使用 “正常” 文件名。

>>> from tempfile import mkdtemp
>>> import os.path as path
>>> filename = path.join(mkdtemp(), 'newfile.dat')

创建一个与我们的数据匹配的 dtype 和形状的 memmap

>>> fp = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='w+', shape=(3,4))
>>> fp
memmap([[0., 0., 0., 0.],
        [0., 0., 0., 0.],
        [0., 0., 0., 0.]], dtype=float32)

将数据写入 memmap 数组

>>> fp[:] = data[:]
>>> fp
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)
>>> fp.filename == path.abspath(filename)
True

将内存更改刷新到磁盘以读取它们

>>> fp.flush()

加载 memmap 并验证数据是否已存储

>>> newfp = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', shape=(3,4))
>>> newfp
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)

只读 memmap

>>> fpr = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', shape=(3,4))
>>> fpr.flags.writeable
False

写时复制 memmap

>>> fpc = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='c', shape=(3,4))
>>> fpc.flags.writeable
True

可以为写时复制数组赋值,但值仅写入数组的内存副本,而不写入磁盘

>>> fpc
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)
>>> fpc[0,:] = 0
>>> fpc
memmap([[  0.,   0.,   0.,   0.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)

磁盘上的文件保持不变

>>> fpr
memmap([[  0.,   1.,   2.,   3.],
        [  4.,   5.,   6.,   7.],
        [  8.,   9.,  10.,  11.]], dtype=float32)

memmap 中的偏移量

>>> fpo = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='r', offset=16)
>>> fpo
memmap([  4.,   5.,   6.,   7.,   8.,   9.,  10.,  11.], dtype=float32)
属性:
filenamestr 或 pathlib.Path 实例

映射文件的路径。

offsetint

文件中的偏移量位置。

modestr

文件模式。

方法

flush()

将数组中的任何更改写入磁盘上的文件。